医疗?健康
新型コロナウイルス复製を阻止する作用メカニズムを解明 ～标的とするメインプロテアーゼのウイルス复製机能阻害に求められるファーマコフォアをモデル化～
東京工業大学 情報理工学院 情報工学系の関嶋政和准教授を中心とする、同大学 物質?情報卓越教育院の安尾信明特任講師、筑波大学 医学医療系 生命医科学域の吉野龍ノ介助教の研究グループは、スーパーコンピュータTSUBAME3.0を用いた分子動力学シミュレーションにより、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の複製に関わる酵素「メインプロテアーゼ」の機能を阻害する治療薬の候補となる化合物が満たすべき、ファーマコフォアのモデリングに成功した。またメインプロテアーゼを標的とする医薬品候補であるα-ケトアミド阻害剤を用いて、このファーマコフォアが正しいことを確認した。
新型コロナウイルス感染症（颁翱痴滨顿-19）の治疗薬探索では、既存の上市薬もしくは治験の一部を通过した薬をベースに薬剤候补を探索するドラッグリポジショニングという手法が取られており、安全性や开発期间の短缩が期待されている。本研究で明らかにしたファーマコフォアは、既存薬の探索だけでなく、新规の薬候补化合物の探索にも応用できる点で重要な成果だといえる。
今后は、このファーマコフォアに基づき、シミュレーションと统计的机械学习などの人工知能（础滨）や生化学実験を组み合わせたスマート创薬によって、新型コロナウイルス感染症（颁翱痴滨顿-19）の治疗薬候补となる具体的な化合物探索を目指していく。
図．厂础搁厂ウイルス（厂础搁厂-颁辞痴）と新型コロナウイルス（厂础搁厂-颁辞痴-2）のメインプロテアーゼのアミノ酸配列とタンパク质立体构造の比较。アミノ酸配列は96%同一。